牙根疼常因根尖炎引起，由于齲壞或生牙周袋等病因沒有得到徹底治療，細菌破壞牙冠，擴散到牙髓中引起牙髓炎。這時如果沒有繼續治療，炎癥則可能會突破根尖孔，進入根尖周組織而形成根尖炎。 其中通過牙周袋形成的是逆行性根尖炎，細菌通過牙周袋到達根尖，再進入牙髓而產生炎癥，炎癥還會進入到根尖周組織，最后形成根尖周炎。急性根尖周炎發作時，多存在牙根疼癥狀，并且患者咬牙時會覺得比鄰牙長，可以確定發病的牙齒。慢性根尖周炎一般沒有特別疼痛的癥狀，但會在根尖區形成瘺孔，這時需要患者到醫院口腔科就診，進行完善的根管治療。