尖銳濕疣的潛伏期是2周到8個月，平均為3個月。 HPV感染在臨床上可以分為臨床型、亞臨床型和潛伏感染。臨床型是指患者出現了臨床癥狀，表現為生殖器及周圍皮膚黏膜出現贅生物，而亞臨床型是指沒有可見的皮疹，亞臨床感染的皮膚黏膜醋酸白試驗陽性，或有尖銳濕疣的病理表現。潛伏感染是指沒有可見的皮疹，亞臨床感染的皮膚黏膜醋酸白陰性或也沒有尖銳濕疣的病理表現。但病毒分子生物學檢查是陽性，HPV感染暫時存在人體時不致病，當這種病毒長期存在，如果人體的免疫功能正常，也不會致病，只有病毒長期存在，機體存在免疫功能低下或存在免疫缺陷時，病毒會表現出致病性。