紅眼病病程是1-2周，如果患者病變較輕，治療比較及時，通常1周以內或者不到1周即可好轉。但是如果病原菌的毒力強，患者治療不及時，同時經常不注意眼睛局部、手部衛生，可能疾病拖延時間較長，需要2周才可逐漸恢復。個別患者超過2周眼睛紅癥狀均無法好轉，急性結膜炎轉為亞急性甚至慢性炎癥，通常是因為治療不及時，而且用藥間斷，不注意眼部清潔衛生，因此疾病需較長時間好轉。