眼睛酸痛流淚，最常見的兩種疾病如下：1、結膜炎：最常見的是過敏性結膜炎，由于眼睛對某些物質過敏，致敏物質對眼睛刺激以后，會形成過敏性結膜炎。過敏性結膜炎會導致眼睛充血、發紅、流淚，有時會有疼痛感；2、角膜炎：不管是角膜發生了外傷，或者角膜產生炎癥，會導致角膜表面上皮損傷，明顯的癥狀是酸疼，刺激性流淚。角膜表面有大量豐富的神經，角膜產生炎癥時，容易刺激對眼睛的感覺，這種疼痛和酸痛的感覺，就比較明顯。同時有一種疼痛的刺激，會導致反射性流淚。眼睛有時會怕光，睜開眼睛時，光線刺激時有疼痛或者流淚的感覺。