腺樣囊性癌屬于惡性腫瘤，惡性度較高，晚期反應主要取決于侵及周圍組織的程度。如腺樣囊性癌可以局部形成較堅韌浸潤塊，當侵及面神經時患者會出現面癱；侵及舌神經和舌下神經會導致舌麻木和舌運動障礙。有時腺樣囊性癌發生在腭部即上牙膛，腫瘤常可沿腭大神經擴散到顱底，甚至長到顱內，其預后與轉移部位相關。 腺樣囊性癌特點是易發生遠處轉移，最常見轉移部位是肺，其次也可能會轉移到肝、骨和腦等。不同部位癥狀不同，如轉移到肺可出現咳嗽、咳血；轉移到肝出現肝部包塊；轉移到骨會出現明顯疼痛等。