小兒心肌損傷可以自愈，部分心肌損傷隨休息或人體病原微生物清除，也可對癥口服營養心肌藥物，促進心肌細胞自身修復。極少數心肌損傷程度較輕微，且患兒沒有相關臨床癥狀，一般情況較好。無需特殊藥物治療，短期內通過自身修復功能，可針對心肌細胞進行修復或緩解治療。大部分急性期后可有所恢復，甚至自愈。患兒在生長發育階段，部分心肌細胞未發育成熟，受到外源性病原刺激或理化因素，導致心肌細胞炎癥、線粒體、細胞膜功能受到影響，可能會出現心肌酶心肌酶高、心電圖輕微改變，也可診斷心肌損傷。