厭氧菌感染在婦科比較常見，無論是陰道炎癥的感染，還是盆腔炎癥的感染，都是比較常見的感染細菌。厭氧菌在陰道炎出現了感染時，被稱為細菌性陰道病，主要的臨床癥狀是比較典型的出現略微稀薄的水樣白帶的同時，還會出現特異性的腥臭味。另外患者在白帶增多時還會出現外陰和陰道瘙癢的這些不適癥狀，當分泌物出現了特有的明顯的腥臭味時就應該高度警惕，有可能是出現了細菌性陰道病，這種厭氧菌感染所導致的陰道炎癥。另外一大類比較明顯的、容易出現的就是女性盆腔炎，大多數是需氧菌、厭氧菌的混合性感染。但無論是需氧菌，還是厭氧菌所導致的盆腔炎癥，大多數女性并不會產生特異性區分的癥狀。任何一種感染導致的女性盆腔炎性疾病都會出現腹痛、下腹墜脹這些不適癥狀，有時可能還會伴隨全身的發熱、寒戰等全身癥狀。因此，在盆腔炎的診斷明確之后，必須給予相應的可以覆蓋到厭氧菌的抗生素，同時給予口服或者靜脈治療，才能夠獲得比較滿意的療效。