短暫性腦缺血發作最主要的病因，見于以下情況：1、栓子因素：心臟或有動脈粥樣硬化的大血管斑塊不穩定的情況下，心臟的栓子或者這種不穩定斑塊的栓子，會隨著血流到遠處的血管栓塞血管，這些栓塞之后的血管可能會堵塞血管，導致一些臨床癥狀。但是過一段時間，隨著這種栓子的崩解，血管的血流又再通，所以這種臨床癥狀會消失；2、小血管病變：如一些小血管有動脈硬化或玻璃樣變等，這種情況下也可以導致一些小血管相關的TIA（短暫性腦缺血發作）；3、大血管病變：可能有一些固定的臨床表現，比如眼動脈的交叉，就是大血管如果出現問題的時候，可以出現一只眼完全的黑蒙，對側肢體會出現偏癱，也就是肢體的無力。這種情況下，可能提示一種大血管相關的TIA。所以不同的短暫性腦缺血發作，病理的基質也不同。