尿毒癥最佳的治療一方面是替代治療，另一方面是其它代謝功能的支持治療。尿毒癥是各種原因引起腎臟損傷到了不可逆的終末狀態，所以一旦診斷了尿毒癥，腎病就無法逆轉，所以這時不是如何逆轉疾病，而是如何去替代腎臟，使得病人的生命能夠維持下去。現在比較成熟的替代腎臟的技術有血液透析、腹膜透析，有條件的病人還可以做腎移植，相對透析來講，腎移植病人的生活質量會更高。血液透析和腹膜透析對于病人來說，做透析會花費一定的時間和精力，但還是能夠維持病人的生命，病人的生活質量有比較好的保證。 除了腎臟替代治療之外，還需要輔助藥物治療，因為腎臟除了排毒、排水之外，還有其他調節人體代謝的作用，透析不能替代這些作用。做透析的病人往往還需要用補鐵的藥物，打促紅細胞生成素促進造血，有些病人有高磷血癥，可能還需要吃含鈣或不含鈣的磷結合劑來調節鈣磷代謝。有些病人有甲狀旁腺功能亢進，還需要用藥物來控制。