對于尖銳濕疣的治療臨床上主要以物理治療為主，結合光動力治療方法，其它藥物治療對防止特殊部位的復發有一定功效。治療首選物理清除，物理清除包含手術切除治療、電離子電刀治療、二氧化碳激光治療、冷凍治療，均是以物理方法將尖銳濕疣疣體清除。尖銳濕疣復發率較高，可能在50%-80%，需要對復發進行干預，有效治療為光動力治療，而非口服干擾素或者其它藥物。即便使用光動力治療，也只能將復發率降到1/10左右，并不能完全做到不復發。