因為囊胚體積較小，排出后肉眼看不到，無論是否種植成功，在天數當中均無特殊臨床表現能代表，可能有少部分女性種植成功有輕微下腹部疼痛，但未出現下腹部疼痛并不代表胚胎著床失敗。所以女性囊胚不著床，胚胎在宮腔內退化之后無分泌物增多或出血等表現，通常與正常未進行胚胎種植的女性將來月經前2周表現相同。如果進行囊胚移植，在胚胎移植進去之后，部分胚胎在當天即開始進行定位、粘附和種植，部分胚胎在宮腔當中可能還會繼續游走1-2天時間才開始進行定位、粘附和著床。如果胚胎進去之后滋養層細胞未在子宮內膜某一個位置進行種植，胚胎則不再繼續發育，基本開始退化，退化之后隨子宮內膜當中腺體分泌的液體同時排出到子宮頸外口及陰道當中。