腦積水的手術費用取決于治療時間及其原發病，如果原發病控制較好，單純腦積水的治療費用通常在3-6萬元之間。如果選擇不可調壓分流泵，其費用比較低，約3-4萬元。如果選擇可調壓分流泵，費用一般在5-6萬元左右。但較多的腦積水患者，其腦脊液成分不達標，在分流之前需要進行較長時間的腦脊液凈化治療，時間可能較長，可達1個月，甚至更長，故治療費用會比較高，可能超過10萬元。目前我國醫療改革一直在向前推進，患者在治療之后，大部分費用可以通過醫保報銷，自己負擔的比例通常較少。