扁桃體摘除手術有一定的適應癥，如有慢性扁桃體炎反復發作，一年病程在七次以上，兩年病程每年發作五次以上，三年病程以上，每年發作三次以上，屬于扁桃體手術切除適應癥之一。另外有扁桃體肥大或扁桃體腫物，可以做扁桃體切除手術。總體，如果是手術適應癥，就可以手術切除，也沒有明顯的副作用和后遺癥。當然，如果不符合手術適應癥的話，首先不建議手術切除。扁桃體手術切除以后，一般沒有明確副作用及其他不良影響，可能有人會有輕微咽干、不適情況，但一般都能耐受，問題不大。不切除可能還會有炎癥反復發作，或引起憋氣、缺氧等更嚴重的后果。所以可能有點咽干、不適，大多數都能適應，對于患者影響不大，所以這也不能成為明顯的副作用。