男生陰莖部位長痘痘的原因如下：1、細菌感染：常見陰莖部位毛囊皮脂腺有細菌感染，出現發炎形成痘痘。產生原因包括內因、外因。外因是局部陰莖部皮膚清潔衛生較差，潮濕多汗容易滋生細菌，導致痘痘形成。如果局部本身存在皮膚病，如濕疹，反復搔抓刺激使皮膚破損，也容易出現細菌感染。內因指平時飲食方面不注意，進食過多辛辣、刺激性食物，導致毛囊皮脂分泌增加；2、基礎疾病：如糖尿病或肝腎疾病，免疫力較低也容易長痘痘；3、性病：尖銳濕疣，主要通過不潔性行為感染人乳頭瘤病毒引起。表現為男性陰莖部位出現單個、多個，如小肉芽一樣的質地柔軟的丘疹，可以隨著時間逐漸生長，建議及時就醫診斷、治療，避免反復發作或傳染他人，引起嚴重后果。