支原體感染，通常采用的治療方案是以抗生素治療為主的藥物治療。抗生素通常根據經驗選擇，也可以根據藥敏的結果進行選用，比較有效和常用的有紅霉素類、大環內酯類，如克林霉素等，以及氟喹諾酮類的抗生素，這些藥物對于治療均有一定的效果。支原體包括人型支原體、肺炎支原體、解脲支原體，這幾類支原體有時會在正常男性、女性的生殖道進行聚集，而有時不引起臨床癥狀。對于臨床實驗室檢查明確支原體感染的患者，而且伴隨明顯的臨床癥狀，如尿頻、尿急、尿痛，或者尿道分泌物，白帶增多、陰道瘙癢等臨床的表現，考慮在實驗室的檢查明確后，采用上述的藥物治療。因為支原體感染可以引起男性的泌尿生殖道的臨床癥狀，并且對于精子以及對于女性的生育具有一定的影響，因此若發現，需及時在專科醫院進行正規的治療。