在傳統的治療方法中，一般采用冷凍治療、激光治療、電灼治療去除肉眼可見的疣體。近年光動力治療是很好的治療方法，不僅可以去除小的疣體，而且可以去除潛在的病毒感染。在疣體去除后，可以外用咪喹莫特軟膏、干擾素軟膏等去除潛伏的病灶，防止尖銳濕疣的復發。另外，對于免疫力低下的患者，可以口服胸腺肽，轉移因子等提高免疫力的藥物，增強機體的免疫功能對抗病毒，減少疾病的復發。對于單個較大的疣體，也可以采用手術治療去除疣體。尖銳濕疣的治療根據患者不同的病情數目和大小，采用不同的方法聯合治療，能取得更好的效果。