一般小針刀治療比普通的針刺要疼一些，小針刀與打肌注疼痛性質有點類似，基本上是在同一個級別上。小針刀的針身要比毫針粗一些，毫針是0.3mm左右，小針刀是0.4-1.0mm，所以小針刀進到人體造成的創傷要比毫針更明顯一些，針刀產生的疼痛感也會更明顯一些。小針刀的針身與注射器的針身基本上類似，所以疼痛感與打針時候的疼痛感有點類似，疼痛級別也會差不多，但是無論是抽血，或者是肌注、輸液，實際上疼痛就是進去那一下。而小針刀疼痛不是只有一下，因為小針刀需要在針刺部位進行切割、剝離，往往會有每個點3-4下，這樣疼痛感會更明顯一些，而且是一種酸脹疼痛感。因為扎到穴位上往往會產生針感，小針刀也是如此，因此酸脹疼痛會更加明顯一些。