男性查HPV病毒感染有以下幾種方式：1、查體：通過查體可以發現男性包皮、冠狀溝及龜頭是否有疣狀新生物，乳頭狀腫物或菜花樣腫物；2、實驗室檢查：如通過3%的醋酸局部涂抹乳頭狀腫物表面，表面在5分鐘后變白，通常提示尖銳濕疣陽性，醋酸試驗陽性可以診斷為尖銳濕疣；3、DNA-HPV檢查：HPV檢查可以通過DNA-HPV檢查，通常通過局部組織分析后，通過DNA檢測來發現有無HPV感染及HPV類型；4、組織病理學檢查：通常在外陰局部通過組織活檢病理的方式來檢測組織中HPV病毒情況，通常可以發現有無HPV病毒感染及HPV病毒感染的類型，還可以預測HPV病毒復發率。