事后避孕藥的副作用也就是緊急避孕藥的副作用，緊急避孕藥不建議作為常規的避孕手段，只有當女性如果沒有采取有效、可靠的避孕措施，而發生了無保護的性生活以后，只能用緊急避孕藥作為補救的避孕措施。具體副作用如下：1、意外妊娠：緊急避孕藥的避孕有效率達不到上環以及口服復方短效避孕藥的有效率，這兩種的避孕方式避孕有效率都可以達到99%以上，而緊急避孕藥的避孕有效率達不到這么高，所以有可能會發生避孕失敗、意外妊娠。所以暫時沒有生育要求的女性，建議要采取確切可靠的避孕措施，不要用緊急避孕藥作為常規的避孕方法；2、影響月經：緊急避孕藥含有激素的量比較大，可能會影響女性的下一次月經，所以服用緊急避孕藥以后，女性會出現下次月經的不正常，月經提前或者月經推遲，或者2次月經之間出現出血的現象，不同的現象與服用緊急避孕藥在月經的不同時期有一定關系。