麻醉藥主要是通過作用于大腦皮層的某些功能核團產生全麻作用，使病人在整個手術過程中，維持比較深的睡眠，維持比較好的鎮靜狀態，從而使術中病人沒有知覺、沒有痛苦。麻醉藥對大腦有影響，但是因為在術中有一系列關于大腦功能的監測，比如血壓監測，以及鎮靜指數的監測，也就是腦電雙頻譜監測，能夠在整個手術過程中，保持比較合適的麻醉狀態。根據每個人的個體狀況，會采取個體化的用藥以及用量，能夠盡量減少麻醉藥，對大腦功能的影響。最主要影響是術中手術過程中如果造成出血，會導致血壓勢降低，產生腦血流供應減少，會導致腦梗的發生。此外，如果病人術中手術牽拉刺激，或者鎮痛、鎮靜的濃度不夠，產生高血壓的變化，術中可能會造成腦出血等嚴重并發癥。但是以上影響都在可控范圍之內，術前在訪視病人時候，如果病人既往有腦梗病史，或者腦出血病人的病史，在用藥過程中就要特別小心，在這方面有特殊的監測和觀察，比如有創動脈壓的監測、腦功能鎮靜指數的監測，能夠有效預防術中麻醉藥對大腦功能的影響。