狼瘡腦病要先確診是否為系統性紅斑狼瘡，有11條診斷標準，如皮膚黏膜的4條標準，包括有無蝶形紅斑、盤狀紅斑、口腔潰瘍、日光過敏等。此外還需要有5個靶器官的損害，包括關節炎癥、腎臟受累、血液系統受累、神經系統受累，如腦炎，以及漿膜腔受累，表現為多漿膜腔積液。檢查結果顯示抗核抗體陽性、免疫學異常，包括特定的標定抗體，如抗雙鏈DNA抗體、史密斯抗體等。另外，高免疫球蛋白血癥、低補體血癥及梅毒假陽性。達到4條診斷標準，即可確診系統性紅斑狼瘡。另外，伴有中樞神經受損，可判斷為狼瘡腦病，需要進行中樞神經系統的專業檢查，如頭顱CT、核磁、腦脊液腰穿檢測。若腦脊液壓力過高，且有蛋白、細胞分離，同時伴有腦血管神經病變，造成的劇烈頭痛、癲肩發作等情況，則就是診斷狼瘡性腦病的標準。由于狼瘡主要是壞死性的血管炎所致，而腦部血管豐富，則會出現腦膜腦炎、急性腦血管病、腦出血、腦梗塞等疾病表現。