頭疼做CT或核磁共振檢查均可，與患者的要求有關，主要分為以下情況：1、CT檢查：CT檢查的特點為簡單、方便、快捷、便宜，并且相比于核磁共振而言，對出血性疾病的敏感度較高，尤其是急性出血。如果患者需排除腦出血或蛛網膜下腔出血時，應首選CT檢查；2、核磁共振：核磁共振的特點是檢查時間長，不同序列較多，對慢性出血的敏感度較高。而針對枕骨大孔以及后顱窩疾病，核磁共振的分辨率高于CT，此時患者應首選核磁共振檢查。