直腸增生息肉除小的丘狀隆起性病變可以定期檢查和嚴密觀察外，一般情況均需行手術治療。手術治療主要包括電灼，即利用熱效應切除；套扎，利用缺血效應來達到治療息肉目的；手術切除，由于手術切除對機體損傷較大，所以要把握好適應癥，對于粗蒂或基底比較廣的息肉，懷疑有惡變及較大息肉距肛門6-7cm，可以在麻醉下經肛門行息肉切除，如果經肛門不能切除，可以經腹來切除。另外，在手術治療中，腹腔鏡的應用越來越廣泛，可以應用腹腔鏡切除位置比較高的直腸息肉，達到微創、恢復快的目的，且還可以獲取較高質量的手術標本。 經過治療后，還要注意日常飲食習慣，多吃新鮮蔬菜、水果，增加膳食纖維的含量，減少有毒、有害物質攝入，盡量少吃油炸、煙熏和腌制類食品，同時要養成良好生活習慣，從而提高機體免疫力。需要強調的是，對于有結直腸息肉家族史及息肉史的人群，應定期檢查，以做到早期發現，早期診斷和早期治療。