小便顏色呈深褐色，首先考慮存在血尿。如果是靜脈性出血，且量較多，尿液的顏色一般呈暗紅色，甚至深褐色，尿常規檢查提示尿液中有大量的紅細胞存在。對于血尿，最重要的是追尋發病原因，而血尿的嚴重程度和疾病的嚴重程度并無相關性，輕癥患者可以出現嚴重的血尿，而重癥患者可以出現不嚴重的血尿。出現血尿98%是泌尿系統的原因，2%是其他系統的原因，除了泌尿系統原因以外，還包括了心血管系統、自身免疫系統、血液系統以及感染等。尿路鄰近器官，如男性生殖系統和女性生殖系統疾病都會導致血尿的發生，運動以后會出現血尿，一些藥物也會引起血尿，所以出現血尿要結合伴隨癥狀以及必要的輔助檢查來明確診斷。另外一種引起小便顏色呈深褐色的原因，是考慮存在有血紅蛋白尿或者肌紅蛋白尿，尿液中如果出現血紅蛋白或者肌紅蛋白，尿液往往呈現濃茶色、紅葡萄色和醬油色。血紅蛋白尿往往見于嚴重的血管內溶血，比如溶血性的貧血、陣發性睡眠性血紅蛋白尿癥、血型不合的輸血。肌紅蛋白尿一般見于擠壓綜合征或者缺血性肌壞死等疾病，劇烈運動的時候，也會出現肌紅蛋白尿，在肌紅蛋白尿當中，尿常規檢測紅細胞呈陰性，但是尿隱血試驗卻呈陽性。