一般臨床上術中快速病理準確率會達到95%以上，但是需要注意快速病理檢查所需要時間非常短，一般在30分鐘之內出結果，而且取材也非常有限，因此也會有一定誤差。 但是錯誤率非常低，尤其是癌癥病人，腫瘤一般比較明確，診斷準確率會達到99%以上，通常術中快速病理檢查結果與術后病理檢查結果相符。術中快速病理檢查，主要用于臨床醫生決定患者的手術方式。