應用紫杉醇時一定要注意不良反應，主要不良反應是過敏反應，與紫杉醇的制造工藝有關，因紫杉醇需要有機溶劑，會引起嚴重的過敏反應，甚至可以危及生命。紫杉醇是臨床上比較常用的化療藥物，適應癥較廣，如頭頸部腫瘤、胸部腫瘤、婦科腫瘤、乳腺腫瘤，使用紫杉醇化療均可取得較好的效果。 所以在用紫杉醇時，通常要提前進行預處理，預處理是預防過敏反應的關鍵。另一個比較常見的不良反應是骨髓抑制，此外還有周圍神經毒性，手指末端和腳趾末端麻木及其他一些不良反應。