ERCP作為一種微創手術，費用相對較高，但比外科開刀要低。正常情況下，手術費大概在15000-20000元之間，如果需要應用膽道的金屬支架，可能要再高出幾千塊錢。 因為ERCP也是一種微創手術，而且消化道是有菌性的，為了盡量減少感染以及交叉感染的幾率，手術所用的器械均為一次性，且不能消毒使用，如ERCP切開刀、造影導管、導絲、取石球囊、擴張球囊、取石網籃和碎石網籃，均是一次性使用。而一次性器械相對費用較高，而且根據患者的情況不同，有時需要放置支架，如石頭過大，不能一次完成，需要放膽道內支架，幾個月后進行第二次治療。另外，部分腫瘤患者，如膽管癌或者胰腺癌失去手術機會，但是患者又出現明顯的黃疸或者消化不良癥狀，需要放置金屬支架，費用可能會再高一些。