主要根據慢性咽炎具體原因，針對病因采取一定的治療方法，盡量去除病因，慢性咽炎才會逐漸好轉。正常咽部也有些淋巴濾泡，有慢性咽炎只是淋巴濾泡會增多，實際上慢性咽炎的不適癥狀不見得就是這些淋巴濾泡導致，或者多數時候不是這些淋巴濾泡導致，而這些淋巴濾泡只是咽喉的一個正常表現。慢性咽炎一個常見的因素，是和胃酸胃液反流刺激導致的反流性咽喉炎有關系。因為反流性咽喉炎，多數患者可以沒有反酸的感覺，所以導致這個因素經常被忽視，也就得不到及時有效的治療。所以導致了反流性咽喉炎的癥狀，包括咽部的異物感、燒灼感、堵塞感、咽癢、咳嗽等不適癥狀容易持續不愈，從而形成慢性咽炎。所以遇到這種情況一定要注意排除胃酸胃液反流的因素，必要時要用抑制胃酸的藥物治療，才能取得好的療效。通常反流性咽喉炎需要連續用藥6個月，才能達到持續穩定的效果。