排卵障礙可由很多原因造成，比如下丘腦病變、垂體病變、卵巢病變，或者其它內分泌疾病。發生排卵障礙，首先要明確病因，查找引起排卵障礙的病因，根據病因進行個體化治療。如精神高度緊張或者過度減重引起下丘腦性閉經，需要進行心理疏導消除精神緊張，或者進行增重以恢復排卵； 垂體病變導致排卵障礙，比如垂體瘤導致排卵障礙。根據垂體瘤的大小采取藥物治療或者手術治療，排卵障礙的女性經過這些處理以后也可以恢復自然排卵； 卵巢病變導致排卵障礙，比如多囊卵巢綜合征的患者需要進行促排卵治療，卵巢早衰的患者需要進行試管嬰兒助孕治療。 內分泌疾病，最常見的就是甲狀腺功能改變，如甲亢或者甲減，患者經過甲狀腺激素調整也可以恢復排卵。