不同原因引起的轉氨酶升高，以及不同程度的轉氨酶升高，疾病嚴重程度千差萬別，恢復時間也不一樣。轉氨酶輕度升高，如服用感冒藥或消炎藥后轉氨酶為60-80U/L，通過充分休息、停藥以及適當的保肝治療，通常1-2周可恢復正常。大量飲酒轉氨酶達到幾十U/L，通過戒酒和服用保肝藥，通常1-2周內也能恢復正常。嚴重的肝損傷，包括乙型肝炎、丙型肝炎和藥物性肝炎引起的重度肝臟受損，如肝臟功能衰竭，轉氨酶可以達到上百甚至上千U/L。同時伴有膽紅素升高，即黃疸，患者可出現眼黃、尿黃，甚至肝昏迷、肝腎綜合征等嚴重的并發癥。這種嚴重肝臟疾患引起的轉氨酶升高，無法短時間恢復正常，需住院治療。針對不同的病因對因治療，并且進行充分的保肝、護肝治療，甚至需要人工肝治療，肝臟功能才有可能恢復。部分患者若肝臟功能不能恢復，甚至需要進行肝移植。