支原體在泌尿系統的感染，往往表現為支原體尿道炎，在臨床上也將其稱為非淋尿道炎。此類的尿道炎往往與不潔的性接觸有關，除了尿頻、尿急、尿痛，幾乎所有的尿道炎都有的癥狀之外，支原體尿道炎有兩個特征性的表現。首先尿道外口的瘙癢感會特別重，所以往往是患者就診時最重要的主訴。其次是患者的尿道外口，無論男女，經常會出現大量稀薄的液體。在做分泌物檢測時，往往能夠發現有支原體的痕跡，這就是支原體尿道炎最常見的表現。在治療上，首先要勸患者一定要潔身自好。另外在治療期間最好禁欲，不要同房。如果性伴侶方便，最好也到醫院做支原體的檢測。其次在治療方面，針對支原體尿道炎，最常用的抗生素是大環內酯類，常用的藥物像羅紅霉素、阿奇霉素，都有很好的治療效果。一般療程是推薦2-4周，等癥狀消失了，推薦再做一次支原體的鑒定。直到病原體消失，才算治療終止。