穴位埋線療法的副作用主要有以下幾點：1、損傷血管：如果埋線時針刺過深，可能會損傷血管，尤其扎到血管后直接將線推進去，會造成比較大的影響，所以埋線時建議避開血管、神經豐富處進行埋線；2、過敏現象：穴位埋線的線通常是羊腸線，屬于蛋白線，部分人對蛋白會產生過敏現象。臨床上部分人也會出現過敏現象，局部出現紅腫、疼痛，出現包塊甚至全身發熱癥狀。所以一般埋線前會問患者是否對蛋白過敏，過敏體質一般不建議埋；3、形成包塊：瘢痕體質人群對線常年不吸收，就會形成包塊，只能埋一次，因為再埋包塊會越來越多。