針灸嚴格按照操作規程通常不會扎壞神經，但在特殊的情況下，如使用特殊的針具和針灸特殊的部位、穴位有可能會扎壞神經。平時使用的針具如普通毫針通常無影響，但較粗的針具如針刀或刃針，扎得較深的情況下，可能會損傷神經。如扎中椎管可能會造成椎管的感染，扎得過深甚至會損傷脊髓。針灸部位通常為穴位，很多穴位位于神經周圍，所以扎著神經或扎在神經的附近為較常見的現象。扎著周圍神經通常影響不大，反而有時需要刺激神經，如坐骨神經痛有時候會要求扎在神經附近，引起放射性的麻木和竄痛的針感。扎中神經后不能進行反復的提、插、捻、轉，有可能會損傷神經。如內關穴處存在正中神經，相對較表淺，針灸內關穴時常會扎到正中神經，針感向手指頭放射，這種情況下則不要進行反復的提插，以免損傷正中神經。