多西環素可以用于尿道炎的治療，主要應用于非淋菌性尿道炎。非淋菌性尿道炎的主要病原微生物是衣原體和支原體，所以在選擇抗生素的治療上主要是針對支原體和衣原體。目前臨床上推薦的治療方案是多西環素和阿奇霉素，其他還可以選擇紅霉素或者左氧氟沙星等。由于考慮到非淋菌性尿道炎是經性傳播途徑傳播，一般建議在治療過程中要暫停性生活，男女雙方同時治療。經過治療以后，大多數患者都可以獲得滿意的療效。對于癥狀持續或者時常反復的患者，除了繼續治療以外，要考慮一下是否存在滴蟲性尿道炎的可能。非淋菌性尿道炎的治愈標準是臨床癥狀消失、尿液澄清、尿道無分泌物、尿常規檢查無異常、尿道和宮頸的分泌物涂片檢查為陰性等。