男性膀胱結石主要見于前列腺增生或有其他尿道梗阻的病人，結石在膀胱內刺激膀胱黏膜。疼痛主要是在下腹部，即常說的小肚子。還有部分平時沒有感覺，小便結束后因為膀胱黏膜收縮、刺激，引起排尿后疼痛。除小肚子疼外，還會有陰莖根部疼痛，甚至部分放射到整個陰莖，包括陰莖頭都會疼痛。小的膀胱結石如果在排尿過程中卡到尿道里，還會引起明顯排尿疼痛、尿分叉或尿流中斷，改變體位后可能疼痛會緩解。