氨碘肽滴眼液的主要副作用，是眼部的過敏，包括過敏性結膜炎、角膜水腫、結膜充血等等。氨碘肽滴眼液是含有有機碘的一種生物制劑，含有多種氨基酸，包括甘氨酸、天冬氨酸、色氨酸等生物制劑。氨基酸可能引起眼部的結膜、角膜等過敏，所以對蛋白質這些物質，可能引起過敏的組織反應，都可能在結膜、角膜上能夠表現出來，形成結膜的充血、水腫，出現畏光、流淚等表現。此類情況主要是因為滴眼液的成分與眼部組織的過敏，引起的一些過敏性反應造成。氨碘肽滴眼液主要是用于早期的白內障、玻璃體混濁等治療。如果對上述成分過敏，需要避用、少用，或者不用氨碘肽滴眼液。