滴蟲感染時，標準的治療方案是采取口服的甲硝唑治療。如果陰道分泌物較多、瘙癢較為嚴重，合并尿頻、尿急等泌尿系感染癥狀時，在口服甲硝唑的同時，也應該給予陰道上藥。在陰道上藥之前，可以用清水洗凈外陰，同時給予甲硝唑栓劑進行治療，周期通常為1周。因滴蟲感染是性傳播性疾病，所以需要夫妻雙方或者性生活的伴侶，均進行檢查和治療。通常治療1周以后停藥3天，到門診進行復查，醫生采取懸滴法或者培養法觀察，如果滴蟲消失則為治愈。患者要進行定期復查，通常復查2-3個周期，如果滴蟲均為陰性，即為感染治愈。在治療期間不能有性生活，才能達到徹底治愈的目的。