智齒正常生長發育時一般不會引起頭痛，只有在特殊情況下才會引起頭痛。發生智齒冠周炎時會引起頭痛，智齒冠周炎表現為智齒周圍牙齦組織腫脹、疼痛，甚至形成冠周膿腫，會放射性引起半側頭痛。 所以，智齒冠周炎引起的頭痛只會發生在同側，不會出現在另外一側。智齒常出現近中斜位阻生，會將前面的牙齒頂壞，形成牙髓炎，牙髓炎發作會引起半側頭痛。智齒本身有齲壞，形成牙髓炎，也會引起半側頭痛。