鏈霉素為第一種用于抗結核的藥物，因鏈霉素對結核桿菌的特效作用，肺結核的治療開啟新紀元。但是隨著鏈霉素的單一用藥，臨床上發現結核桿菌逐步對鏈霉素產生耐藥性，導致患者的治療效果逐漸不佳。 隨著異煙肼、利福平的發明，兩者合用后提高了結核病的治療效果，并減少了結核分枝桿菌的耐藥性。目前結核分枝桿菌對鏈霉素的耐藥性已非常嚴重，絕大部分耐多藥肺結核患者均對鏈霉素耐藥，加上鏈霉素有較多的副作用，比如鏈霉素可對患者的聽力造成損害，長時間的應用可致耳鳴甚至耳聾，且鏈霉素對患者的腎功能亦有損害，所以鏈霉素目前較少應用于臨床。 現在耐多藥肺結核患者主要選用阿米卡星、卷曲霉素進行治療，但這些藥物對聽力、腎功能也會產生不同程度的影響，所以世界衛生組織最新治療耐多藥的指南中，推薦如果有可代替的藥物，優先選擇口服藥從而代替注射藥物。