應用事后避孕藥，即緊急避孕藥后，如果發生無保護措施的性生活，可能發生意外妊娠。緊急避孕藥，只是無保護性生活的補救措施，也僅限于本次性生活，并不意味著服用藥物后，短時間內持續有效。并且即使按照說明書的指導，正確應用緊急避孕藥，也可能發生意外妊娠，因為緊急避孕藥并非100%能夠避孕。所以盡管這類避孕藥的效果值得肯定，但也存在避孕失敗可能性。如果應用緊急避孕藥，短期內進行無保護性生活，發生意外妊娠的可能性可能增加。另外緊急避孕藥，可能對女性月經造成影響，因此應避免短時間內頻繁應用。