多囊卵巢囊腫通常不通過調節以及治療較難自愈。多囊卵巢囊腫由卵泡不排卵造成，女性表現為不來月經或月經稀發，如幾個月才來一次，后續會影響女性的生育功能。主要需通過藥物治療，首先需調節女性月經，保證規律的月經，后續再促排卵，一旦產生排卵，囊腫會相對減少，其次需幫助女性生育。使用一段時間藥物后，多數女性可能會恢復自主、規律的月經，即疾病得到控制，有規律的月經，卵巢通常就不會表現多個囊腫。但部分特殊的情況，如情緒波動、分娩甚至流產后，可能再次出現月經不調，以及卵巢多個囊腫等情況。部分患者體重有所增加，肥胖女性可以改善糖耐量異常的情況，如通過鍛煉、控制飲食等，將體重恢復到正常情況。這時部分女性會恢復自主的月經周期，卵巢多個囊腫的表現也會得到改善。