如果藥物流產流不干凈，可能導致的后果具體如下：1、感染：長期出血會導致感染，而血液為細菌最好的培養基。由于陰道屬于有菌環境，此時會發生細菌上行感染，造成流產后感染，還可能會發生宮腔粘連，甚至會導致不孕癥的風險；2、大出血：由于流產不全，胚胎殘留在宮腔中，如果出現脫落，在脫落過程中可能會出現大出血。流產不干凈的患者可以選擇繼續吃藥，將殘留物排除，或者是進行清宮治療，即在無菌操作下將殘留的胚胎組織清除，避免出現潛在風險。如果藥物流產時孕周過大，通過藥物流產也不能將殘留物完全排出，則應及時清宮。而如果藥流時孕周較小，但患者存在反復宮腔操作史，如多次流產或進行過剖腹產手術，流產不干凈的可能性則會增大，所以需要密切關注患者情況。