右側腎臟疼痛，主要有以下原因：1、泌尿系結石：腎結石發生排石，排到輸尿管中，病人可感覺右側腎區疼痛；2、泌尿系腫瘤：包括腎癌、血管平滑肌脂肪瘤，或者單純就是囊腫病變時。也可能病變受到外力后，發生破裂出血，或者是自發性破裂出血，均可導致右側腎區劇烈疼痛，嚴重時還可危及生命；3、泌尿系畸形：先天性腎盂輸尿管連接部狹窄、馬蹄腎類的畸形，均可導致一側腎臟積水，甚至有時還會合并感染等疾病，病人可感覺到右側腎區疼痛。