肝移植術后包括近期并發癥和遠期并發癥問題，近期并發癥包括腹腔內出血，即術中、術后大出血。還有包括移植肝動脈血栓或移植中肝動脈破裂，門靜脈血栓和腔靜脈狹窄或腔靜脈出血，主要涉及出血與血栓問題，屬于近期并發癥。近期并發癥，因為急性排斥反應引起膽道損害；長期并發癥，因為患者長期服用免疫抑制劑，可能發生免疫抑制劑相關副作用，如感染或肝功能損害以及慢性排斥反應，出現膽道并發癥等。其它并發癥也較多。