頭痛的針灸治療是依據中醫的辨證論治來選穴，外感頭痛一般會選百會穴、合谷穴、風池穴、風府穴、曲池穴、太陽穴；如果有發熱，會選大椎穴、天柱穴；如果有血管性頭痛，會選頭維穴、角孫穴；如果有神經性頭痛，可以加風池穴、風府穴；血虛頭痛一般會取上清穴、血海穴、足三里穴、三陰交穴；瘀血頭痛一般會取合谷穴、三陰交穴，也可以取血海穴；風濕頭痛一般取穴是風池穴、頭維、合谷、豐隆；如果是肝陽上亢的頭痛，一般會取懸顱、太沖、行間等穴位。