卵巢囊腫并無確切原因，可能與女性內分泌有關，卵巢囊腫是良性病變，分為生理性囊腫和病理性囊腫。生理性囊腫見于黃體囊腫或濾泡囊腫，與排卵后黃體形成有關，生理性囊腫可能2-3個月會自己消退，無需干預。 卵巢囊腫經過觀察后，如幾個月后復查囊腫未消失反而長得更大，可能是病理性囊腫，需要重視干預。如卵巢巧克力囊腫，可看作特殊類型的卵巢囊腫，子宮內膜異位到卵巢導致。病理性卵巢囊腫應手術治療，若持續存在或存在增大趨勢，均需手術干預。若患者第一次發現囊腫，可短時間觀察2-3個月，若持續存在或囊腫長大，且直徑＞5cm，需手術治療。臨床上卵巢囊腫很多并無癥狀，大部分于體檢時發現。