目前在市面上已經可以開始使用的HPV疫苗有二價、四價以及九價，二價疫苗主要是含有HPV16型和HPV18型兩種病毒的疫苗，二價疫苗主要是針對于宮頸癌有預防作用，因為HPV16型和HPV18型都是導致女性發生宮頸癌最為常見，也是最高風險的病毒類型。HPV16型可能會與女性的宮頸鱗狀上皮癌有密切的關系，HPV18型則與女性腺上皮癌的關系非常密切，所以二價疫苗的注射可以起到預防女性發生宮頸癌的作用。四價疫苗在HPV16型和HPV18型的基礎上增加了兩種低危型的HPV病毒，也就是HPV6型和HPV11型，這兩型病毒主要是導致女性生殖道的尖銳濕疣，所以四價疫苗在預防宮頸癌的同時，還可以起到預防性傳播疾病的作用。九價疫苗是在四價疫苗的基礎上又增加了對幾種HPV病毒的預防作用，所以目前市面上只有二價、四價和九價的HPV疫苗。