四價疫苗指的是HPV疫苗，是針對4個HPV病毒的亞型，而九價疫苗針對9種亞型，其主要針對高危型，以及2個低危型。2個低危型即HPV6型和11型，此2型主要引起外陰的尖銳濕疣，是一種性病，其他的都是高危型。四價的疫苗針對6型、11型、16型和18型。HPV16型和18型是非常高危的2種類型，尤其16型占到一半的宮頸癌，16和18型宮頸癌兩者加起來占到將近70％多的宮頸癌。其他的高危型，其中九價疫苗還針對另5種高危型HPV病毒，包括31型、33型、45型、52型和58型，是臨床感染比較常見的高危HPV病毒。所以四價和九價的疫苗，只是針對病毒的種類有區別。