藥物流產本身的安全性較高，藥物流產主要是通過口服米非司酮和前列腺素，來終止停經49天之內的早期妊娠。米非司酮可以改變子宮內膜環境，使胚胎不容易發育或停止發育，還可使宮頸軟化。再服用前列腺素，前列腺素可使子宮收縮，將胚胎排出體外。藥物流產成功率和患者的年齡有關，通常適用于18-40歲的女性，如果患者在40歲以上，藥物流產的成功性較低，孕囊較大也會使得藥物流產失敗。藥物流產有時會發生流產不干凈的情況，需要做刮宮手術，有時也會出現藥物流產失敗的情況，需要再做人工流產手術。