扁桃體有膿包，應根據不同原因進行不同治療，常見原因如下：1、急性化膿性扁桃體炎：應進行血常規觀察感染的指標，如果中性粒細胞或白細胞過高，尤其超過15×10^9，建議靜脈給予抗生素，如青霉素類的哌拉西林、阿莫西林克拉維酸鉀等，也可以是一代或二代的頭孢。如果是成年人，非孕期、非哺乳期可以給予喹諾酮類藥物。如果中性粒細胞和白細胞升高較小，此時可以口服抗生素，如果扁桃體有膿包，可以給予清熱解毒的中成藥，比如藍芩口服液、蒲地藍消炎口服液、金銀花口服液、咽炎合劑等；2、扁桃體結石：如果沒有出現疼痛，扁桃體表面有較多的膿點，扁桃體可能有結石，甚至扁桃體長期有細菌定植，可能需要進行扁桃體切除術。扁桃體就像細菌的培養基，始終在身體內釋放不良物質，當機體抵抗力一旦下降時會爆發，引起全身性感染等不適。